2009-ben Emma Los Angelesb�l a New York-i Greenwich Village-be k�lt�z�tt. Emma �desanyj�n�l mellr�kot diagnosztiz�ltak. Krist�nak 2009-ban siker�lt legy�znie a r�kot. 2010-ben Emma �s csal�dja meg�nnepelt�k, hogy �desanyja k�t �ve r�kmentes, erre a k�l�nleges alkalomra �rt egy levelet Paul McCartneynak �s megk�rte, hogy rajzoljon le kett� mad�r l�bat, mert az �desanyja kedves dala az 1968-ban r�gz�tett The Beatles – Blackbird c�m� sz�ma. Paul v�grehajtotta a k�r�st, Stone �s �desanyja egyforma csukl� tetov�l�st csin�ltatott. Az�ta Emma j�t�konys�gi munk�t v�gzet a Stand Up to Cancern�l �s a Revlonn�l is.

2008-ban ismerte meg a zeneszerz�, �nekes, �s egyben sz�n�sz p�rj�t, Teddy Geiger-t A meztelen dobos c�m� film forgat�sa idej�n. Majd szak�tottak �s 2010-ben Kieran Culkinnal kezdett randizni. Vele a Ryan Reynolds, a k�pzelt szuperh�s forgat�s�n ismerkedett meg

2011 k�zep�n kezdett el tal�lkozgatni Andrew Garfield-dal. 2015. �prilis�ban azonban a sz�n�szn� �s Andrew elmondta, hogy sz�netet tartanak kapcsolatukba. Andrew �j filmje forgat�sa kapcs�n Tajvanon van, m�g a sz�n�szn� Los Angelesben tart�zkodik �s pihen testv�r�vel, Spencerrel.

2019-ban jegyezt�k el egym�st Dave McCary, majd 2020-ban titokban �sszeh�zasodtak. Majd 2021 m�rcius�ban megsz�letett kisl�nyuk Louise Jean McCary.